Ustroj
Zbog prostorne razdvojenosti svoje matične ustanove SMK djeluje s dvije područne knjižnice. Njezin središnji dio (Šalata 3) sačinjavaju:
- studentski odjel s obimnim fondom udžbenika i priručnika, te studentskom čitaonicom,
- zbirka inozemnih časopisa koji pokrivaju područja pretkliničkih znanosti i onih kliničkih disciplina koje su smještene na Šalati,
- zbirka domaćih medicinskih časopisa,
- referentna zbirka, koja uključuje najvažnije biomedicinske sekundarne i tercijarne publikacije,
- zbirka monografskih publikacija, s bogatom zbirkom medicinske Croatice,
- zbirka doktorskih i magistarskih radnji obranjenih na Medicinskom fakultetu u Zagrebu.
Medicinska knjižnica Rebro (Kišpatićeva 12) najsnažnija je hrvatska zbirka inozemnih časopisa svih kliničkih disciplina, a posjeduje i obimnu zbirku monografskih publikacija kliničke orijentacije.
Knjižnica Klinike za ženske bolesti i porode (Petrova 13) sadrzi časopise i knjige, koje su najvećim dijelom vezane uz područje ginekologije i porodništva.